Ketika Scrat sengaja memprovokasi sebuah bencana kontinental dengan badai, Manny dipisahkan dari Ellie dan buah persik pada sebuah gunung es dengan Diego, Sid, dan nenek tetapi dia berjanji bahwa ia akan menemukan cara untuk kembali ke rumah. Sementara menyeberangi lautan, mereka ditangkap oleh bajak laut kejam Gutt kapten dan krunya. Namun mereka melarikan diri dan Manny plot sebuah rencana untuk mencuri Gutt kapten kapal dan kembali ke tanah airnya di perjalanan berbahaya melalui laut. Tetapi para perompak kejam mencari balas dendam terhadap Manny dan keluarganya dan teman-teman.
